BZOJ1264: [AHOI2006]基因匹配

MatchTime Limit: 10 Sec  Memory Limit: 162 MB
Description

基因匹配(match) 卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球,这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成(地球上只有4种),而更奇怪的是,组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次!这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成,那么它的长度一定是5N。 卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦,而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题,于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理,我们需要先定义子序列的概念:若从一个DNA序列(字符串)s中任意抽取一些碱基(字符),将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u,则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2,如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列,则称u是s1和s2的公共子序列。 卡卡已知两个DNA序列s1和s2,求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序:  从输入文件中读入两个等长的DNA序列;  计算它们的最大匹配;  向输出文件打印你得到的结果。

Input

输入文件中第一行有一个整数N,表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基,以后将它们编号为1…N的整数。 以下还有两行,每行描述一个DNA序列:包含5N个1…N的整数,且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。

Output

输出文件中只有一个整数,即两个DNA序列的最大匹配数目。

Sample Input

2
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1

Sample Output

7

HINT

[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中:1<=N <= 1 000
100%的测试数据中:1<=N <= 20 000

Source


/**************************************************************

    Problem: 1264

    User: ictsing

    Language: C++

    Result: Accepted

    Time:400 ms

    Memory:3944 kb

****************************************************************/

 

//BZOJ1264 [AHOI2006]基因匹配Match

#include <iostream>

#include <cstdio>

#include <algorithm>

#include <cstring>

using namespace std;

int cnt[40000+5];

int pos[40000+5][6];

int f[200000+5];

int n;

int c[200000+5];

inline int read()

{

    int num=0,flag=1;

    char ch;

    do{

        ch=getchar();

        if(ch=='-') flag=-1;

    }while(ch<'0'||ch>'9');

    do{

        num=num*10+ch-'0';

        ch=getchar();

    }while(ch>='0'&&ch<='9');

    return num*flag;

}

int get(int x)

{

    int ans=0;

    while(x)

        ans=max(ans,c[x]),x-=x&(-x);

    return ans;

}

void update(int x,int y)

{

    while(x<=5*n)

        c[x]=max(c[x],y),x+=x&(-x);

}

int main()

{

    n=read();

    for(int i=1;i<=n*5;i++) 

    {

        int x=read();

        pos[x][++cnt[x]]=i;

    }

    int ans=0;

    for(int i=1;i<=n*5;i++)

    {

        int x=read();

        for(int j=5;j>=1;j--)

        {

            int y=pos[x][j];

            f[y]=max(f[y],get(y-1)+1);

            update(y,f[y]);

            ans=max(ans,f[y]);

        }

    }

    printf("%d\n",ans);

    return 0;

}

 


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